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醫療技術鑒定機構的優點是服務意識較強，委托人或許能有一點“上帝”感；缺點是具有片面性，結論不易被采信。醫學會的優勢在于醫療技術力量雄厚，其劣勢在于同行情結與法律欠缺，其缺點在行政處理時還能被掩蓋，但受法院委托從事司法鑒定時總難免暴露出來。

醫學會鑒定多數時候顯得同行相護，個別情況同行相侵；鑒定人不署名、不出庭使鑒定結論作為證據具有致命的程序缺陷；鑒定結論總是注重是否醫療事故，對案件來說往往答非所問。司法鑒定的優勢在于中立性強，與案件處理的協調性強，缺點在于醫療技術力量不充分，常常需要聘請專家，費用較大，否則可能因技術不全面而影響鑒定的科學性。醫療糾紛發生后，選擇醫療技術鑒定機構需要高度重視，與案件的處理的最終結果息息相關。鑒定機構的中立性與專業水平是最重要的考慮因素，但中立性更應優先考慮。

二、申請醫療損害鑒定需要什么材料

申請醫療損害鑒定需要的材料如下：

1.患方提交材料：

(1)患者身份證；

(2)患方陳述；

(3)代理人委托書；

(4)門診病歷、住院病歷復印件、其他醫院就診治療檢查等病歷原件。

2.醫療機構提交材料：

(1)醫療機構執業許可證(復印件)；

(2)經治醫護人員執業、注冊證原件及復印件；

(3)醫方答辯；

(4)醫方代理委托書；

(5)住院患者的病程記錄、死亡病例討論記錄、疑難病例討論記錄、會診意見、上級醫師查房記錄等病歷資料原件；

(6)住院患者的住院志、體溫單、醫囑單、化驗單(檢驗報告)、醫學影像檢查資料、特殊檢查同意書、手術同意書、手術及麻醉記錄單、病理資料、護理記錄等病歷資料原件。